南方紅豆杉病蟲害較少。雨季濕度大，透風(fēng)較差的部分會發(fā)生根腐、莖腐甚至爛根，可用70%敵克松500～800倍液噴施；對于葉枯病和赤枯病，可用1%波爾多液噴施防治。目前發(fā)現(xiàn)的蟲害主要有蚧殼蟲、蚜蟲等，分別可采用速撲殺1000倍液、10%吡蟲啉乳劑噴施防治。